祖母绿宝石有裂纹是正常的。因为宝石的质地脆祖母绿最简单鉴定方法，在祖母绿的生成过程中，与某些杂质矿物包在内部生长，形成包裹体，开采中也极易产生开裂，因此优质的祖母绿产量极少，价格相对于其他宝石也高。
天然的祖母绿存在很多的裂隙，由于具有很强的脆性，为了提高净度及降低加工切割风险，当祖母绿原石被开采出来就会马上被浸入无色雪松油中，直到进行切割。这种方法称为（浸油）也是被宝石界接受和认可的纯天然优化方式。
另外，由于祖母绿有着丰富的包裹体，内部完全纯净的大颗粒宝石尤为稀少，这是因为宝石受到着色成分和矿物生长环境的影响。其内含物非常多，宝石界专家会将祖母绿的内部结构描述为（Jardin),在法语中是（花园）的意思。
这就是祖母绿宝石特有的“花园效应”。由于祖母绿生动鲜活的绿色，使它成为宝石界非常独特的宝石。然而，真正质地优良的祖母绿是极其罕见的，特别是它的内含物会影响祖母绿的颜色与价值，也由于它不同的内含物，便可以分辨出宝石产地及其生长环境的不同。它的内含物不但不会削弱其价值，相反，有内含物的祖母绿其价值更高于无内含物及裂纹但颜色却暗淡的祖母绿。当祖母绿的内含物或裂纹变得多而复杂时，这个特点证明宝石是天然的。
